Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y333

LSM2, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM2Q9Y333 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSM2Q9Y333 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSM2Q9Y333 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSM2Q9Y333 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSM2Q9Y333 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSM2Q9Y333 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LSM2Q9Y333 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LSM2Q9Y333 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LSM2Q9Y333 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms