Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF6Q9Y252 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF6Q9Y252 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF6Q9Y252 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF6Q9Y252 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF6Q9Y252 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RNF6Q9Y252 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF6Q9Y252 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms