Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GNEQ9Y223 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GNEQ9Y223 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
GNEQ9Y223 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GNEQ9Y223 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GNEQ9Y223 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GNEQ9Y223 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GNEQ9Y223 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
GNEQ9Y223 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GNEQ9Y223 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GNEQ9Y223 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GNEQ9Y223 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GNEQ9Y223 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GNEQ9Y223 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GNEQ9Y223 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms