Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDRG4Q9ULP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDRG4Q9ULP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDRG4Q9ULP0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDRG4Q9ULP0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDRG4Q9ULP0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NDRG4Q9ULP0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDRG4Q9ULP0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDRG4Q9ULP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NDRG4Q9ULP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDRG4Q9ULP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms