Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCNH3Q9ULD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCNH3Q9ULD8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCNH3Q9ULD8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
KCNH3Q9ULD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KCNH3Q9ULD8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
KCNH3Q9ULD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KCNH3Q9ULD8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KCNH3Q9ULD8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KCNH3Q9ULD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KCNH3Q9ULD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KCNH3Q9ULD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KCNH3Q9ULD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
KCNH3Q9ULD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KCNH3Q9ULD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
KCNH3Q9ULD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KCNH3Q9ULD8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms