Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKZ1

CNOT11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11Q9UKZ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT11Q9UKZ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNOT11Q9UKZ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT11Q9UKZ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNOT11Q9UKZ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CNOT11Q9UKZ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CNOT11Q9UKZ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNOT11Q9UKZ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNOT11Q9UKZ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNOT11Q9UKZ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT11Q9UKZ1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms