Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDF2Q9UK05 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDF2Q9UK05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GDF2Q9UK05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDF2Q9UK05 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDF2Q9UK05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDF2Q9UK05 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF2Q9UK05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GDF2Q9UK05 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF2Q9UK05 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF2Q9UK05 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms