Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK7

RABL2A, Rab-like protein 2A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL2AQ9UBK7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RABL2AQ9UBK7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RABL2AQ9UBK7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABL2AQ9UBK7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RABL2AQ9UBK7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RABL2AQ9UBK7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABL2AQ9UBK7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABL2AQ9UBK7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABL2AQ9UBK7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms