Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNFX1Q9P2E3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
ZNFX1Q9P2E3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ZNFX1Q9P2E3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNFX1Q9P2E3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
ZNFX1Q9P2E3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZNFX1Q9P2E3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNFX1Q9P2E3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZNFX1Q9P2E3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZNFX1Q9P2E3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZNFX1Q9P2E3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZNFX1Q9P2E3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZNFX1Q9P2E3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNFX1Q9P2E3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZNFX1Q9P2E3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZNFX1Q9P2E3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNFX1Q9P2E3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNFX1Q9P2E3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZNFX1Q9P2E3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZNFX1Q9P2E3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNFX1Q9P2E3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ZNFX1Q9P2E3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZNFX1Q9P2E3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNFX1Q9P2E3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZNFX1Q9P2E3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms