Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALCOCO1Q9P1Z2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALCOCO1Q9P1Z2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALCOCO1Q9P1Z2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALCOCO1Q9P1Z2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms