Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EXD2Q9NVH0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EXD2Q9NVH0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EXD2Q9NVH0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EXD2Q9NVH0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXD2Q9NVH0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXD2Q9NVH0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EXD2Q9NVH0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXD2Q9NVH0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXD2Q9NVH0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms