Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TM7SF3Q9NS93 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TM7SF3Q9NS93 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TM7SF3Q9NS93 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TM7SF3Q9NS93 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TM7SF3Q9NS93 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TM7SF3Q9NS93 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TM7SF3Q9NS93 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms