Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PFDN4Q9NQP4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PFDN4Q9NQP4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PFDN4Q9NQP4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PFDN4Q9NQP4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PFDN4Q9NQP4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PFDN4Q9NQP4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PFDN4Q9NQP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PFDN4Q9NQP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PFDN4Q9NQP4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PFDN4Q9NQP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms