Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPS7BQ9H9Q2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COPS7BQ9H9Q2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COPS7BQ9H9Q2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPS7BQ9H9Q2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPS7BQ9H9Q2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COPS7BQ9H9Q2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COPS7BQ9H9Q2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COPS7BQ9H9Q2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms