Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W4

PLEKHF2, Pleckstrin homology domain-containing family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF2Q9H8W4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLEKHF2Q9H8W4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLEKHF2Q9H8W4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLEKHF2Q9H8W4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLEKHF2Q9H8W4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLEKHF2Q9H8W4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLEKHF2Q9H8W4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PLEKHF2Q9H8W4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms