Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPA3Q9H6K4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPA3Q9H6K4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPA3Q9H6K4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPA3Q9H6K4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OPA3Q9H6K4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
OPA3Q9H6K4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OPA3Q9H6K4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OPA3Q9H6K4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OPA3Q9H6K4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OPA3Q9H6K4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OPA3Q9H6K4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OPA3Q9H6K4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms