Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2H8

PPIL3, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase-like 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIL3Q9H2H8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPIL3Q9H2H8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPIL3Q9H2H8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPIL3Q9H2H8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPIL3Q9H2H8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PPIL3Q9H2H8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPIL3Q9H2H8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPIL3Q9H2H8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPIL3Q9H2H8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPIL3Q9H2H8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPIL3Q9H2H8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms