Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SRRTQ9BXP5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SRRTQ9BXP5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SRRTQ9BXP5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SRRTQ9BXP5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SRRTQ9BXP5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRRTQ9BXP5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SRRTQ9BXP5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRRTQ9BXP5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.37
SRRTQ9BXP5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SRRTQ9BXP5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRRTQ9BXP5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRRTQ9BXP5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRRTQ9BXP5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRRTQ9BXP5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRRTQ9BXP5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms