Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTKNQ9BST9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTKNQ9BST9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RTKNQ9BST9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RTKNQ9BST9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTKNQ9BST9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTKNQ9BST9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTKNQ9BST9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTKNQ9BST9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTKNQ9BST9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTKNQ9BST9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RTKNQ9BST9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RTKNQ9BST9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms