Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX50Q9BQ39 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX50Q9BQ39 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DDX50Q9BQ39 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX50Q9BQ39 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DDX50Q9BQ39 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX50Q9BQ39 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DDX50Q9BQ39 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX50Q9BQ39 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX50Q9BQ39 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX50Q9BQ39 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DDX50Q9BQ39 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DDX50Q9BQ39 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms