Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF18Q99633 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF18Q99633 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF18Q99633 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRPF18Q99633 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRPF18Q99633 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF18Q99633 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF18Q99633 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF18Q99633 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF18Q99633 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF18Q99633 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF18Q99633 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF18Q99633 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRPF18Q99633 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRPF18Q99633 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms