Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1Q99536 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VAT1Q99536 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VAT1Q99536 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VAT1Q99536 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VAT1Q99536 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VAT1Q99536 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1Q99536 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
VAT1Q99536 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VAT1Q99536 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
VAT1Q99536 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
VAT1Q99536 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VAT1Q99536 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.53■■■□□ 2
VAT1Q99536 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VAT1Q99536 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VAT1Q99536 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAT1Q99536 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VAT1Q99536 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VAT1Q99536 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1Q99536 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1Q99536 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms