Protein–RNA interactions for Protein: Q99500

S1PR3, Sphingosine 1-phosphate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR3Q99500 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S1PR3Q99500 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S1PR3Q99500 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
S1PR3Q99500 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
S1PR3Q99500 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
S1PR3Q99500 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
S1PR3Q99500 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
S1PR3Q99500 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
S1PR3Q99500 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
S1PR3Q99500 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms