Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFXN2Q96NB2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFXN2Q96NB2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFXN2Q96NB2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFXN2Q96NB2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFXN2Q96NB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SFXN2Q96NB2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SFXN2Q96NB2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFXN2Q96NB2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFXN2Q96NB2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms