Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF578Q96N58 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF578Q96N58 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ZNF578Q96N58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZNF578Q96N58 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF578Q96N58 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF578Q96N58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF578Q96N58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF578Q96N58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF578Q96N58 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF578Q96N58 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF578Q96N58 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF578Q96N58 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF578Q96N58 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF578Q96N58 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms