Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF48Q96MX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF48Q96MX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF48Q96MX3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF48Q96MX3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF48Q96MX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF48Q96MX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms