Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE2Q96MF7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMCE2Q96MF7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE2Q96MF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMCE2Q96MF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NSMCE2Q96MF7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSMCE2Q96MF7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NSMCE2Q96MF7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE2Q96MF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE2Q96MF7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE2Q96MF7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NSMCE2Q96MF7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NSMCE2Q96MF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.7 ms