Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NINJ1Q92982 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NINJ1Q92982 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NINJ1Q92982 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NINJ1Q92982 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NINJ1Q92982 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NINJ1Q92982 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINJ1Q92982 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NINJ1Q92982 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NINJ1Q92982 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NINJ1Q92982 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NINJ1Q92982 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NINJ1Q92982 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NINJ1Q92982 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NINJ1Q92982 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms