Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NINJ1Q92982 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NINJ1Q92982 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NINJ1Q92982 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NINJ1Q92982 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NINJ1Q92982 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NINJ1Q92982 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NINJ1Q92982 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NINJ1Q92982 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NINJ1Q92982 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NINJ1Q92982 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINJ1Q92982 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NINJ1Q92982 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NINJ1Q92982 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NINJ1Q92982 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NINJ1Q92982 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NINJ1Q92982 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NINJ1Q92982 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NINJ1Q92982 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NINJ1Q92982 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NINJ1Q92982 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NINJ1Q92982 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NINJ1Q92982 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NINJ1Q92982 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NINJ1Q92982 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NINJ1Q92982 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NINJ1Q92982 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NINJ1Q92982 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NINJ1Q92982 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NINJ1Q92982 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NINJ1Q92982 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NINJ1Q92982 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NINJ1Q92982 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NINJ1Q92982 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NINJ1Q92982 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NINJ1Q92982 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NINJ1Q92982 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NINJ1Q92982 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NINJ1Q92982 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NINJ1Q92982 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NINJ1Q92982 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NINJ1Q92982 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NINJ1Q92982 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NINJ1Q92982 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NINJ1Q92982 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NINJ1Q92982 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NINJ1Q92982 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NINJ1Q92982 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NINJ1Q92982 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINJ1Q92982 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINJ1Q92982 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NINJ1Q92982 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NINJ1Q92982 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NINJ1Q92982 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NINJ1Q92982 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NINJ1Q92982 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NINJ1Q92982 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NINJ1Q92982 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NINJ1Q92982 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NINJ1Q92982 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NINJ1Q92982 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NINJ1Q92982 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NINJ1Q92982 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NINJ1Q92982 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NINJ1Q92982 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NINJ1Q92982 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NINJ1Q92982 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NINJ1Q92982 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NINJ1Q92982 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NINJ1Q92982 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NINJ1Q92982 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NINJ1Q92982 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NINJ1Q92982 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NINJ1Q92982 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NINJ1Q92982 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ1Q92982 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NINJ1Q92982 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NINJ1Q92982 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NINJ1Q92982 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NINJ1Q92982 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINJ1Q92982 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NINJ1Q92982 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NINJ1Q92982 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NINJ1Q92982 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINJ1Q92982 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NINJ1Q92982 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms