Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL2Q92772 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDKL2Q92772 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKL2Q92772 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL2Q92772 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDKL2Q92772 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDKL2Q92772 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDKL2Q92772 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms