Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC13A3Q8WWT9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC13A3Q8WWT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC13A3Q8WWT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC13A3Q8WWT9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC13A3Q8WWT9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC13A3Q8WWT9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC13A3Q8WWT9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC13A3Q8WWT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC13A3Q8WWT9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms