Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN9

IPCEF1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPCEF1Q8WWN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IPCEF1Q8WWN9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IPCEF1Q8WWN9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IPCEF1Q8WWN9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IPCEF1Q8WWN9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IPCEF1Q8WWN9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IPCEF1Q8WWN9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IPCEF1Q8WWN9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IPCEF1Q8WWN9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms