Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA6DQ8NFY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA6DQ8NFY4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMA6DQ8NFY4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6DQ8NFY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6DQ8NFY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6DQ8NFY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SEMA6DQ8NFY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SEMA6DQ8NFY4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms