Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSANTD4Q8NCY6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MSANTD4Q8NCY6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSANTD4Q8NCY6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSANTD4Q8NCY6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MSANTD4Q8NCY6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MSANTD4Q8NCY6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSANTD4Q8NCY6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MSANTD4Q8NCY6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MSANTD4Q8NCY6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MSANTD4Q8NCY6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms