Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MFSD2AQ8NA29 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MFSD2AQ8NA29 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MFSD2AQ8NA29 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MFSD2AQ8NA29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MFSD2AQ8NA29 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MFSD2AQ8NA29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MFSD2AQ8NA29 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MFSD2AQ8NA29 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170 ms