Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PARP8Q8N3A8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PARP8Q8N3A8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP8Q8N3A8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP8Q8N3A8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PARP8Q8N3A8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP8Q8N3A8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PARP8Q8N3A8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PARP8Q8N3A8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PARP8Q8N3A8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PARP8Q8N3A8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PARP8Q8N3A8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP8Q8N3A8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PARP8Q8N3A8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PARP8Q8N3A8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PARP8Q8N3A8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PARP8Q8N3A8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PARP8Q8N3A8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PARP8Q8N3A8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms