Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP8Q8N3A8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP8Q8N3A8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PARP8Q8N3A8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PARP8Q8N3A8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP8Q8N3A8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PARP8Q8N3A8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP8Q8N3A8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP8Q8N3A8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PARP8Q8N3A8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP8Q8N3A8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PARP8Q8N3A8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP8Q8N3A8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PARP8Q8N3A8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PARP8Q8N3A8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PARP8Q8N3A8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PARP8Q8N3A8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PARP8Q8N3A8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PARP8Q8N3A8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP8Q8N3A8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP8Q8N3A8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PARP8Q8N3A8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PARP8Q8N3A8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PARP8Q8N3A8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP8Q8N3A8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PARP8Q8N3A8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PARP8Q8N3A8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PARP8Q8N3A8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PARP8Q8N3A8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP8Q8N3A8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PARP8Q8N3A8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PARP8Q8N3A8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PARP8Q8N3A8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP8Q8N3A8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP8Q8N3A8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP8Q8N3A8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PARP8Q8N3A8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PARP8Q8N3A8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PARP8Q8N3A8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PARP8Q8N3A8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP8Q8N3A8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP8Q8N3A8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP8Q8N3A8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP8Q8N3A8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARP8Q8N3A8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP8Q8N3A8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARP8Q8N3A8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARP8Q8N3A8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PARP8Q8N3A8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PARP8Q8N3A8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARP8Q8N3A8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARP8Q8N3A8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARP8Q8N3A8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARP8Q8N3A8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARP8Q8N3A8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARP8Q8N3A8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP8Q8N3A8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP8Q8N3A8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP8Q8N3A8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP8Q8N3A8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP8Q8N3A8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP8Q8N3A8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP8Q8N3A8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP8Q8N3A8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PARP8Q8N3A8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PARP8Q8N3A8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PARP8Q8N3A8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARP8Q8N3A8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARP8Q8N3A8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARP8Q8N3A8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARP8Q8N3A8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARP8Q8N3A8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARP8Q8N3A8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP8Q8N3A8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARP8Q8N3A8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP8Q8N3A8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARP8Q8N3A8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARP8Q8N3A8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP8Q8N3A8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP8Q8N3A8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARP8Q8N3A8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARP8Q8N3A8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARP8Q8N3A8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP8Q8N3A8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP8Q8N3A8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PARP8Q8N3A8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP8Q8N3A8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PARP8Q8N3A8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP8Q8N3A8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PARP8Q8N3A8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PARP8Q8N3A8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PARP8Q8N3A8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PARP8Q8N3A8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PARP8Q8N3A8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms