Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC4Q7Z404 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
TMC4Q7Z404 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TMC4Q7Z404 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TMC4Q7Z404 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TMC4Q7Z404 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC4Q7Z404 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMC4Q7Z404 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC4Q7Z404 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TMC4Q7Z404 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TMC4Q7Z404 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms