Protein–RNA interactions for Protein: Q76KD6

SPATC1, Speriolin, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATC1Q76KD6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SPATC1Q76KD6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATC1Q76KD6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATC1Q76KD6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATC1Q76KD6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATC1Q76KD6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATC1Q76KD6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATC1Q76KD6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPATC1Q76KD6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPATC1Q76KD6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPATC1Q76KD6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SPATC1Q76KD6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPATC1Q76KD6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms