Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATG16L1Q676U5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG16L1Q676U5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG16L1Q676U5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATG16L1Q676U5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG16L1Q676U5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG16L1Q676U5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATG16L1Q676U5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATG16L1Q676U5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATG16L1Q676U5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATG16L1Q676U5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATG16L1Q676U5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATG16L1Q676U5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG16L1Q676U5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms