Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RNF123Q5XPI4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RNF123Q5XPI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RNF123Q5XPI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RNF123Q5XPI4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RNF123Q5XPI4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RNF123Q5XPI4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RNF123Q5XPI4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RNF123Q5XPI4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
RNF123Q5XPI4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RNF123Q5XPI4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
RNF123Q5XPI4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
RNF123Q5XPI4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RNF123Q5XPI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RNF123Q5XPI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
RNF123Q5XPI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RNF123Q5XPI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms