Protein–RNA interactions for Protein: Q53RY4

KRTCAP3, Keratinocyte-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP3Q53RY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRTCAP3Q53RY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRTCAP3Q53RY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KRTCAP3Q53RY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRTCAP3Q53RY4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRTCAP3Q53RY4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRTCAP3Q53RY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP3Q53RY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRTCAP3Q53RY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRTCAP3Q53RY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms