Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FNDC1Q4ZHG4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FNDC1Q4ZHG4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FNDC1Q4ZHG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FNDC1Q4ZHG4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FNDC1Q4ZHG4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FNDC1Q4ZHG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FNDC1Q4ZHG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
FNDC1Q4ZHG4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FNDC1Q4ZHG4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
FNDC1Q4ZHG4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms