Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KHDC1Q4VXA5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KHDC1Q4VXA5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KHDC1Q4VXA5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KHDC1Q4VXA5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KHDC1Q4VXA5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KHDC1Q4VXA5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KHDC1Q4VXA5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KHDC1Q4VXA5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KHDC1Q4VXA5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms