Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SVEP1Q4LDE5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SVEP1Q4LDE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SVEP1Q4LDE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SVEP1Q4LDE5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SVEP1Q4LDE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SVEP1Q4LDE5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SVEP1Q4LDE5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms