Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PROX2Q3B8N5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PROX2Q3B8N5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PROX2Q3B8N5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PROX2Q3B8N5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PROX2Q3B8N5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PROX2Q3B8N5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PROX2Q3B8N5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PROX2Q3B8N5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.9 ms