Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATP6V1FQ16864 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP6V1FQ16864 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP6V1FQ16864 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP6V1FQ16864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP6V1FQ16864 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP6V1FQ16864 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP6V1FQ16864 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1FQ16864 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms