Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCD2Q16342 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDCD2Q16342 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDCD2Q16342 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDCD2Q16342 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDCD2Q16342 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDCD2Q16342 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDCD2Q16342 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCD2Q16342 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
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