Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SYCP1Q15431 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SYCP1Q15431 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SYCP1Q15431 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP1Q15431 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SYCP1Q15431 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP1Q15431 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SYCP1Q15431 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP1Q15431 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SYCP1Q15431 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SYCP1Q15431 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SYCP1Q15431 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SYCP1Q15431 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SYCP1Q15431 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SYCP1Q15431 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYCP1Q15431 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYCP1Q15431 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
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