Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NKX1-1Q15270 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NKX1-1Q15270 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
NKX1-1Q15270 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
NKX1-1Q15270 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NKX1-1Q15270 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
NKX1-1Q15270 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NKX1-1Q15270 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
NKX1-1Q15270 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
NKX1-1Q15270 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
NKX1-1Q15270 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NKX1-1Q15270 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
NKX1-1Q15270 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
NKX1-1Q15270 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NKX1-1Q15270 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NKX1-1Q15270 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NKX1-1Q15270 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NKX1-1Q15270 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NKX1-1Q15270 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NKX1-1Q15270 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NKX1-1Q15270 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NKX1-1Q15270 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NKX1-1Q15270 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NKX1-1Q15270 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NKX1-1Q15270 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NKX1-1Q15270 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NKX1-1Q15270 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NKX1-1Q15270 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NKX1-1Q15270 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms